Sinopsis singkat dari anime ini, yang diproduksi oleh Crunchyroll, adalah sebagai berikut:
Beberapa ribu tahun setelah fenomena misterius yang mengubah seluruh populasi manusia menjadi batu, seorang anak laki-laki yang sangat cerdas dan berorientasi pada ilmu pengetahuan, Senku Ishigami, terbangun. Di dunia yang sekarang terbuat dari batu dan hancur lebur, Senku memutuskan untuk menggunakan ilmu pengetahuan untuk membangun kembali peradaban yang telah hilang. Bersama dengan teman masa kecilnya yang kuat, Taiju Oki, yang juga terbangun dalam keadaan batu, mereka berdua memulai perjalanan panjang mereka untuk membangun peradaban baru dari awal.
